کتاب «موسوعه آیات الأحکام » تحقیق آیاتی است که در بر دارنده احکام فقهی است و همچنین اقوال و فتاوای فقهای شیعه و اهل تسنن در این زمینه را مورد بررسی قرار می‌دهد.

در هر مبحث، بعد از ذکر آیه‌ای از آیات الأحکام که حاوی حکم و یا احکامی در موضوع تحقیق می‌باشد، امور ذیل مورد بررسی قرار می‌گیرد:

• ذکر معانی لغوی کلمات آیه، با استناد به کتب معتبر لغوی و نیز اختصاراً اشاره به مباحث نحوی
• ذکر شأن نزول آیات قبل از ورود به دیگر مباحث مربوطه، در صورتی که برای آیه، شأن نزول بیان شده باشد.
• تفسیر و تبیین مفهوم آیه، با استفاده از تفاسیر مشهور و معروف شیعه و اهل سنّت.
• بیان احکام مستفاد از آیه.

جلد اول این کتاب مشتمل بر یک مقدمه و پنج فصل است، در مقدمه به اهمیت مراجعه به شأن نزول قرآن، تفسیر، اقسام تفسیر، مدرسه تفسیر نزد امامیه، حجیت ظواهر قرآن، نسبت آیات الأحکام به کل قرآن، و معرفی کتاب‌هایی که امامیه و اهل تسنن در آیات الأحکام تألیف کرده‌اند، اشاره شده است.

فصل اول کتاب طهارت نام دارد که خود مشتمل بر دو مبحث است و در آن از مطهریت آب، معنای طهارت از نظر شیعه و اهل تسنن و اقسام طهارت بحث شده است.

فصل دوم مشتمل بر وضو، ادله وجوب وضو و واجبات آن است و در فصل سوم به وجوب غسل جنابت، وجوب غسل حیض، وجوب غسل میت، و ادله حرمت مس قرآن بدون وضوء، اشاره شده است.

مباحث فصل چهارم عبارتند از ادله وجوب تیمم، مسوغات تیمم، تیمم نزد اهل سنت، واجبات تیمم، چیزی‌های که تیمم بر آنها جایز است و احکام متعلق به تیمم.

در فصل پنجم این کتاب، نجاسات مورد بررسی قرار گرفته و مشتمل بر شش مبحث است.